أفادت وسائل إعلام فلسطينية بأن النظام السوري الجديد اعتقل خالد خالد المسؤول عن الساحة السورية في منظمة الجهاد الإسلامي الفلسطينية وأبو علي ياسر، المسؤول عن اللجنة التنفيذية للمنظمة في سوريا.
ولا يوجد تأكيد رسمي من السلطات السورية في هذا الشأن.
وحتى سقوط نظام الأسد، كان كبار مسؤولي الجهاد الإسلامي في فلسطين، بمن فيهم زياد النخالة، يتمركزون في سوريا. قبل سقوط النظام بفترة وجيزة، فر النخالة من البلاد، لكن وفقا لتقارير وسائل الإعلام العربية، لا يزال بعض المقاتلين نشطين في البلاد.