ذكرت صحيفة نيويورك تايمز أن إيران تعقد اجتماعا طارئا للمجلس الأعلى للأمن القومي في مقر إقامة المرشد الأعلى، وهو حدث يعقد في ظل ظروف استثنائية، وفقا لمسؤولين إيرانيين كبيرين. وأفيد أيضا أن قائد فيلق القدس كان حاضرا أيضا في الاجتماع، وأن كبار المسؤولين الإيرانيين كانوا “في حالة صدمة كاملة بعد الاغتيال على أراضيهم. وفي البرلمان الإيراني، أشار متحدث باسم لجنة الشؤون الخارجية والدفاع إلى الحادث وادعى أنه سيكون هناك رد على الاغتيال.
وبعد الإجتماع، صدر أول تصريح قيادي رسمي في إيران. وقال الرئيس مسعود بزشكيان إن إيران “ستدافع عن وحدة أراضيها وكرامتها وشرفها وعزتها، وستجعل المحتلين الإرهابيين يندمون على عملهم الجبان” باغتيال زعيم حماس إسماعيل هنية في طهران.